Perfil profesional y de investigación

Estudié Microbiología y Química Clínica (Universidad de Costa Rica) y tengo un Diploma de Postítulo en Bioinformática y Biología Computacional (Universidad de Chile). Actualmente me desempeño como la profesional encargada del Laboratorio de genómica y biología molecular del Inciensa que forma parte de las redes de vigilancia genómica regional de la OPS (PAHOGen) y es uno de los laboratorios de referencia de secuenciación de la Red Regional de Vigilancia Genómica de virus respiratorios RESVIGEN.

Mis principales funciones son la supervisión, ejecución, implementación y desarrollo de técnicas moleculares y de secuenciación para identificación y tipificación de patógenos de importancia en salud pública. Tengo experiencia en secuenciación de microorganismos con distintas plataformas. Estoy interesada en la aplicación de técnicas genómicas para la investigación de brotes y en el área de epidemiología genómica.

He participado como instructora en talleres de secuenciación y análisis bioinformático de microorganismos (SARS-CoV-2, influenza, dengue y bacterias transmitidas por alimentos) para la región de Centroamérica y el Caribe y otros países como Bolivia, Venezuela y Cuba. Participé en la Consulta Regional de la OPS con los laboratorios de referencia de COVIGEN sobre Mejores Prácticas para Realizar Vigilancia Genómica de Patógenos Respiratorios con Potencial Pandémico.

Publicaciones representativas

Duarte F, Cordero E, Calderon M, Godinez A, Ross B, Allard M, Gonzalez-Escalona N. 2024. Closed genomes of four multidrug resistance Salmonella enterica serotype Infantis isolated in Costa Rica. Microbiol Resour Announc 13:e00257-23. https://doi.org/10.1128/MRA.00257-23

Melany Calderón-Osorno, Estela Cordero-Laurent, Francisco Duarte-Martínez. 2023. CoVEx: SARS-CoV-2 Mutation Explorer for genomic surveillance, Infection, Genetics and Evolution, volume 116, , 105521, ISSN 1567-1348, https://doi.org/10.1016/j.meegid.2023.105521.

Molina-Mora Jose Arturo, Reales-González Jhonnatan, Camacho Erwin, Duarte-Martínez Francisco, Tsukayama Pablo, Soto-Garita Claudio, Brenes Hebleen, Cordero-Laurent Estela, Ribeiro dos Santos Andrea, Guedes Salgado Cláudio, Santos Silva Caio, Santana de Souza Jorge, Nunes Gisele, Negri Tatianne, Vidal Amanda, Oliveira Renato, Oliveira Guilherme, Muñoz-Medina José Esteban, Salas-Lais Angel Gustavo, Mireles-Rivera Guadalupe, Sosa Ezequiel, Turjanski Adrián, Monzani María Cecilia, Carobene Mauricio G., Remes Lenicov Federico, Schottlender Gustavo, Fernández Do Porto Darío A., Kreuze Jan Frederik, Sacristán Luisa, Guevara-Suarez Marcela, Cristancho Marco, Campos-Sánchez Rebeca, Herrera-Estrella Alfredo. 2023. Overview of the SARS-CoV-2 genotypes circulating in Latin America during 2021. Frontiers in Public Health, Mar 2;11:1095202. doi: 10.3389/fpubh.2023.  https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10018007/

Molina-Mora JA, González A, Jiménez-Morgan S, Cordero-Laurent E, Brenes H, Soto-Garita C, Sequeira-Soto J, Duarte-Martínez F. 2022. Clinical Profiles at the Time of Diagnosis of SARS-CoV-2 Infection in Costa Rica During the Pre-vaccination Period Using a Machine Learning Approach. Phenomics, Jun 7;2(5):312-322. doi: 10.1007/s43657-022-00058-x. https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9173838/

Molina-Mora, J.A., Cordero-Laurent, E., Calderón-Osorno, M. et al. 2022. Metagenomic pipeline for identifying co-infections among distinct SARS-CoV-2 variants of concern: study cases from Alpha to Omicron. Sci Rep 12, 9377. https://doi.org/10.1038/s41598-022-13113-4

Molina-Mora JA, Cordero-Laurent E, Godínez A, Calderón-Osorno M, Brenes H, Soto-Garita C, Pérez-Corrales C; COINGESA-CR Consorcio Interinstitucional de Estudios Genómicos del SARS-CoV-2 Costa Rica, Drexler JF, Moreira-Soto A, Corrales-Aguilar E, Duarte-Martínez F. 2021. SARS-CoV-2 genomic surveillance in Costa Rica: Evidence of a divergent population and an increased detection of a spike T1117I mutation. Infect Genet Evol. Aug;92:104872. doi: 10.1016/j.meegid.2021.104872. https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8065237/

Cursos y capacitaciones impartidas

Expositora en las “VI Jornadas de Bioinformática Clínica: retos de la ciencia genómica y bioinformática”. Ministerio de Salud de Costa Rica, Consejo técnico de bioinformática clínica. Octubre, 2024.

Instructora del taller de bioinformática para virus dengue en el 18vo Curso Internacional de Dengue y otros Arbovirus emergentes. Instituto de Medicina Tropical «Pedro Kourí», La Habana, Cuba. Agosto, 2024.

Instructora del Taller en secuenciación genómica de Virus Dengue. Centro Nacional de Enfermedades Tropicales, Cenetrop, Bolivia. Agosto, 2023.

Instructora del Taller de reforzamiento de secuenciación genómica y análisis bioinformático para Influenza y SARS-CoV-2. Instituto Costarricense de Investigación y Enseñanza en Nutrición y Salud, Costa Rica. Junio, 2023.

Instructora del Taller de secuenciación de genoma completo y análisis bioinformático de SARS-CoV-2 para laboratorio de salud pública de El Salvador. Instituto Costarricense de Investigación y Enseñanza en Nutrición y Salud, Costa Rica. Noviembre, 2022.

Expositora en el “Ciclo de Charlas Bioinformática Aplicada a la Clínica 2022”. Ministerio de Salud de Costa Rica, Consejo técnico de bioinformática clínica. Octubre, 2022

Docente en la capacitación teórico-práctica en laboratorio y análisis de secuenciación de genoma completo. Red PulseNet América Latina y el Caribe. Instituto Costarricense de Investigación y Enseñanza en Nutrición y Salud, Costa Rica. Setiembre, 2022.

Instructora del Taller Análisis bioinformático de secuencias genómicas de SARS-CoV-2 y otros patógenos de importancia en salud pública para laboratorios de salud pública de centroamérica y República Dominicana. Instituto costarricense de investigación y enseñanza en nutrición y salud, Costa Rica. Agosto, 2022.